La deuxième lettre de Paul à Timothée a été écrite entre 66 et 67 après JC. Elle se compose essentiellement de conseils personnels de Paul à Timothée, qui était son jeune collègue et assistant. Le thème principal est la persévérance. Timothée est encouragé à continuer à témoigner fidèlement de Jésus-Christ, à se tenir à l'enseignement véritable de la Bonne Nouvelle et de l'Ancien Testament et à faire son devoir en tant que professeur et évangéliste, face à toutes souffrances et oppositions.
Timothée est particulièrement mis en garde face aux dangers de l’implication dans « des arguments insensés et ignorants, des spéculations absurdes et sans fondements » (2:23) qui ne font aucun bien, mais qui détruisent les gens qui les écoutent.
En tout cela, l’écrivain rappelle à Timothée son propre exemple et son objectif, ainsi que sa foi, sa patience, son amour, son endurance et sa souffrance dans la persécution.